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深国交毕业生的讲述 - 专业与职业篇 (上) SCIE 2020(30)

92708 人参与  2020年08月11日 11:16  分类 : 纵观深国交  评论


深国交毕业生的讲述 - 专业与职业篇 (上) SCIE 2020(30)  深国交 深圳国际交流学院 学在国交 第8张

深圳国际交流学院2011届校友 邵岩

2011年进入伦敦帝国理工学院。

2014 年取得生物学一等荣誉学士学位,皇家科学学院会员。

实习于世界领先的科研机构英国John Innes Centre, The Sainsbury Laboratory 和深圳华大基因研究院。

2015 年获四年全额奖学金攻读剑桥大学博士学位,进入全球三大基因组测序研究中心之一Wellcome Sanger Institute 展开人类微生物组学研究,期间在 Nature, Nature Biotechnology等顶级学术期刊发表5篇文章。


2011届校友、剑桥博士邵岩在《Nature》期刊上也以第一作者的身份发表了他的科研论文。

这篇文章阐述道,邵岩所在的研究组通过高通量全基因组测序和分析,进行了迄今为止对新生儿肠道菌群规模最大,精度最高的研究。他们提供了强有力的证据表明,不同分娩方式对生命早期肠道菌群发育起着决定性作用。研究组希望通过肠道微生物研究,能够帮助贫困国家预防和改善儿童的营养不良问题,也有助于结束富裕国家儿童肥胖症的流行,防止哮喘、过敏和一些自身免疫性疾病。

这篇文章于英国时间9月18日于Nature官网上线,当天就被英国以及国际各大主流媒体首页报道。近一个月来文章下载量超过3.7万次,论文影响力(Altmetric)指数在同期Nature 文章(4/484)和所有科研文章(23/174,693)中均列1%。同时,国内包括新华社在内各大中文网站和科普自媒体也对这一研究进行介绍(链接见文末)。10月3日,文章被正式刊登在 Nature 杂志第574卷,第7776期。

现在,我们不妨一起来看看这位年轻科学家的求学与科研之路~


Q:

能不能讲述一下你高中之后的求学经历?

2011年我进入伦敦帝国理工生命科学系,进行本科学习。母校浓厚的学术氛围和紧贴科研的教学课程,有助于我在本科期间培养较强的科研素养,这体现在大量的前沿文献批判性阅读,论文、综述和研究计划的撰写,以及在实验室的科研实习经历。

大一大二暑假期间,我得到英国Gatsby 慈善基金会的全额资助,先后被筛选参加暑期科研培训项目。我有幸进入世界最顶尖的微生物和植物研究所英国John Innes Centre 和The Sainsbury Laboratory进行科研实习,和“教科书里的”科学家们工作交流。

2014年本科毕业后,我回到深圳进入华大基因实习。在积累工业界工作经验的同时,进一步学习生物信息和大数据分析技术。这些宝贵经历让我深刻体会到最顶尖的科研成果是怎样“炼”成的,也让我找到了最感兴趣的科研方向—微生物-宿主相互作用和基因组学。

2015年,我得到Wellcome Trust (世界最大的慈善基金之一) 的全额奖学金,开始在剑桥大学为期四年的博士学习,并进入基因组学研究“圣地” Sanger 研究所展开人类肠道微生物组学研究。具体来说,我的研究课题是利用大规模基因组测序和高通量细菌分离培养技术,研究生命早期人体肠道微生物群从无到有的发展过程,以及其与生命后期哮喘等过敏性疾病的关系。

Q:

这次在Nature上面发表的文章,能具体讲讲是什么样的研究和发现吗?

其实我们的体内只有约一半细胞是人体细胞,另一半则代表着由数亿个微生物和病毒组成的,遍布各个器官的微生态系统。这其中以人体肠道内的微生物菌群最为庞大和最复杂,也和我们的代谢,免疫系统最紧密相连。许多研究表明,受到饮食,服用抗生素,压力等影响时人体肠道微生物群会出现失调,并可能会诱发癌症和肥胖、炎症性肠病等疾病。然而在婴儿出生的最初几周内,肠道微生态系统是怎样完成从一无所有到庞大复杂的发育过程呢?有哪些因素会影响婴儿肠道菌群的发育?婴儿肠道菌群的发育缺陷是否会造成后期自身免疫性疾病(如哮喘,过敏)?

带着这些问题,我们研究组和合作者们展开了一项为时七年的大型出生队列研究 (2012年起筹办, 2015年起大规模招募、采样),并将其中一项重大发现在Nature 上发表。在这篇文章中,我们通过高通量全基因组测序和分析,进行了迄今为止对新生儿肠道菌群规模最大,精度最高的研究。我们提供了强有力的证据表明,不同分娩方式对生命早期肠道菌群发育起着决定性作用。

我们发现,在顺产情况下,婴儿通过母亲产道时出生时“继承”了许多母亲粪便中的肠道细菌。这类母婴间传播的细菌不但对对肠道健康有益,也是生命早期肠道菌群发育过程中的“主心骨”;而在剖腹产过程中,我们发现这种来自母亲的肠道菌群”遗传”几乎被彻底破坏。令人惊讶的是,剖腹产出生的婴儿不但永久无法得到来自母体的有益肠道菌,反而携带着非常高比例的,在医院环境中常见的潜在致病细菌。至于剖腹产婴儿在出生后的肠道菌群紊乱以及携带大量致病菌对他们的健康究竟有着怎样的影响,请关注我们接下来的临床研究。

Q:

你今后的研究方向会是什么?

在顺利完成博士学业后(最近顺利通过毕业答辩),我在未来一两年内会留在当前的研究团队完成其他将要发表的工作。同时,我们也将目光放眼全球,在盖茨基金会(Bill & Melinda Gates Foundation)的资助下,和中低收入国家的研究人员合作,展开对非洲和拉丁美洲婴儿肠道菌群的大型队列研究。

近期,我将拜访位于肯尼亚,南非和乌拉圭的合作者进行学术交流和知识传递。我们希望通过肠道微生物研究,能够帮助贫困国家预防和改善儿童的营养不良问题,也有助于结束富裕国家儿童肥胖症的流行,防止哮喘、过敏和一些自身免疫性疾病。

深国交毕业生的讲述 - 专业与职业篇 (上) SCIE 2020(30)  深国交 深圳国际交流学院 学在国交 第9张

深国交校友邵岩和孟根屹在10月3日Nature期刊上同期发表的科研论文


我们真诚地祝贺在科研领域有着如此重大发现、取得突出成就的校友们,是你们的潜心钻研和锲而不舍为世界科技发展助力,为人类生活带来福祉。

你们,是改变世界的人!深国交作为母校因你们而骄傲!


相关媒体对于该论文的报道

(可复制链接到网页阅读)

Nature 原文(pdf):  https://rdcu.be/bUiaS

Sanger 研究所媒体通稿:

https://www.sanger.ac.uk/news/view/babies-gut-bacteria-affected-delivery-method-baby-biome-project-shows

Nature 同期配发的新闻专题:

https://www.nature.com/articles/d41586-019-02807-x

Nature 中文微信推送:

https://mp.weixin.qq.com/s/JKvnQbkVEFBKUjgBspeEWg

国际各大主流媒体报道:

路透社: 

https://uk.reuters.com/article/us-health-babybiome/baby-gut-study-finds-bacteria-different-after-c-section-births-idUKKBN1W32CB

法新社: 

https://www.france24.com/en/20190918-gut-feeling-how-c-sections-change-a-baby-s-gut-ecosystem

新华社: 

http://www.xinhuanet.com/world/2019-09/20/c_1125018899.htm

英国BBC: 

https://www.bbc.co.uk/news/health-49740735

英国 Sky News:

https://news.sky.com/story/babies-born-by-c-section-lack-healthy-gut-bacteria-from-mother-study-finds-11813777

英国每日电讯报(头版): 

https://www.telegraph.co.uk/science/2019/09/18/gut-bacteria-caesarean-babies-found-abnormal-bringing-fears/

英国卫报:

https://www.theguardian.com/society/2019/sep/18/caesarean-babies-have-different-gut-bacteria-microbiome-study-finds

美国CNN:

https://edition.cnn.com/2019/09/18/health/babies-gut-microbiome-birth-vaginal-c-section-intl/index.html

西班牙 El País:

https://elpais.com/elpais/2019/09/18/ciencia/1568820835_254811.html

中文科普媒体解读:

生物探索:Nature迄今最大规模研究证实:剖腹产宝宝缺少关键菌群

https://www.biodiscover.com/news/park/735470.html

学术经纬:剖腹产果然会影响婴儿菌群!《自然》发布迄今最大规模研究

https://mp.weixin.qq.com/s/Pu-0jDCUiFXHysxDccTSXQ

奇点网:《自然》:剖宫产毁肠菌!迄今最大规模研究表明,分娩方式会严重影响婴儿肠菌,剖宫产婴儿微生物多来自医院,是潜在致病菌丨临床大发现

https://mp.weixin.qq.com/s/xI1JP8J7Fe_tdkRVqoq90A

知几未来研究院:打脸“阴道播种”| Nature刊发迄今最大规模新生儿菌群研究,发现顺产儿肠道菌来自母亲肠道而非阴道,剖宫产儿则多是医院致病菌

https://mp.weixin.qq.com/s/xTIvrcixMGBHGC5mKbqlWQ


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